Introduction
Le test chromogénique embryon est une technique de laboratoire employée dans le cadre du diagnostic et de la prévention de certaines affections chez la femme enceinte et son fœtus. Il repose sur la détection de bactéries spécifiques dans la flore vaginale, et plus particulièrement des bactéries vaginales à haut risque infectieux (BVHRI). Cet article vise à définir ce test, à explorer ses applications cliniques, et à examiner les risques associés à la présence de certaines bactéries dans la flore vaginale pendant la grossesse.
Flore Vaginale et Risque Infectieux
La flore vaginale est un écosystème complexe de micro-organismes, dominé par la flore de Döderlein. Cependant, certaines bactéries commensales peuvent présenter un risque infectieux pour la femme enceinte et son fœtus. Ces bactéries, présentes en petit nombre, ne sont pas toujours visibles au Gram et sont souvent repérées uniquement en culture. Les principales BVHRI appartiennent aux groupes II et III de la flore commensale, les portages les plus fréquents concernant Streptococcus agalactiae (Streptocoque du groupe B) et Escherichia coli. Moins fréquemment, on retrouve Haemophilus spp, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes et N. meningitidis, qui peuvent entraîner des complications plus graves.
Streptococcus agalactiae (Streptocoque du groupe B)
10 à 20 % des femmes enceintes sont porteuses de Streptococcus agalactiae. Le risque de transmission au fœtus est d'environ une fois sur deux. Bien que les conséquences de ce portage soient rares, elles peuvent être graves, avec 1 à 2 % des nouveau-nés susceptibles de développer une infection néonatale telle que bactériémie ou méningite. Il est important de noter que le Streptococcus agalactiae est le seul germe capable d’infecter le nouveau-né indépendamment de la présence de facteurs de risque infectieux.
Méthodologie du Test Chromogénique
Le test chromogénique pour la détection de Streptococcus agalactiae implique l'ensemencement par quadrant d'une GELOSE COLUMBIA AU SANG. L’observation microscopique des colonies après coloration de Gram révèle des coques à Gram positif dont le mode de groupement n’est pas toujours caractéristique. De plus, Streptococcus agalactiae, comme tous les Streptococcus, est catalase négative.
La réponse est donnée de façon semi-quantitative : négative, 1+, 2+, 3+, 4+ en fonction du nombre de quadrants sur lesquels une croissance de S. agalactiae est observée. Cela permet de quantifier le risque de faible (1+) à majeur (4+).
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Certains milieux utilisés sont chromogènes : ils permettent la détection d’activités enzymatiques conférant une coloration caractéristique. Les enzymes recherchées sont l’alpha-glucosidase et l’estérase.
Applications Cliniques
La recherche de BVHRI s’effectue sur prescription explicite du clinicien. L'objectif principal est de détecter la présence de Streptococcus agalactiae chez la femme enceinte afin de prévenir les infections néonatales précoces. Les données actuelles ne justifient pas le dépistage systématique en fin de grossesse des BVHRI autres que Streptococcus agalactiae, selon les recommandations de l'ANAES (Agence Nationale d'Accréditation et d'Évaluation en Santé) de 2001.
Conséquences d'une Colonisation par BVHRI
Les BVHRI peuvent coloniser la cavité amniotique du nouveau-né par voie ascendante, suite à l’ouverture prématurée du col ou à la rupture prématurée des membranes. Cette colonisation peut évoluer vers une chorioamniotite, qui se manifeste par de la fièvre et des contractions utérines, mettant le fœtus en souffrance.
Autres Techniques de Diagnostic Moléculaire
Outre le test chromogénique, d'autres techniques de diagnostic moléculaire sont utilisées pour identifier des anomalies génétiques ou moléculaires.
Hybridation In Situ (FISH et CISH)
Les techniques FISH (hybridation in situ fluorescente) et CISH (hybridation in situ chromogénique) sont des techniques de cytogénétique moléculaire. L’hybridation in situ repose sur les propriétés de dénaturation et de renaturation de l’ADN. Une sonde ADN est dénaturée puis hybridée sur des préparations chromosomiques également dénaturées. La technique CISH utilise des anticorps ou de l’avidine conjugués avec des enzymes qui vont développer une réaction chromogénique. La CISH permet de déterminer le nombre de copies du gène cible, le nombre de copies du centromère ou le ratio copies gène cible/copies centromère.
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Séquençage de Nouvelle Génération (NGS)
Le NGS (Next-Generation Sequencing) regroupe l’ensemble des techniques de séquençage dit « massivement parallèles ». Elles consistent à séquencer dans le même temps tous les fragments d’ADN présents dans un échantillon. Les séquences d’ADN obtenues sont alignées au génome de référence par homologie. Les différences entre l’ADN séquencé et le génome de référence sont identifiées par des algorithmes.
Autres Maladies et Conditions Médicales
Il est pertinent de noter que d'autres maladies et conditions médicales peuvent être liées à des mécanismes complexes impliquant des réactions immunitaires, des mutations génétiques ou des infections.
Maladie de Crohn
La maladie de Crohn est une maladie inflammatoire de l'intestin dont le mécanisme implique le lymphocyte T et la production de cytokines inflammatoires. Plusieurs études épidémiologiques ont suggéré une responsabilité du virus de la rougeole lorsque l'exposition se fait in utéro ou lors de la première enfance.
Maladie de Castleman (MC)
La maladie de Castleman est une hypertrophie ganglionnaire avec hyperplasie lymphoïde angiofolliculaire. L'HHV8 est trouvé chez 60 à 100% des patients atteints de MC associée au VIH, mais aussi chez 20 à 40% des patients VIH négatifs.
Cancer et Marqueurs Tumoraux
Au cours de la surveillance d’un patient atteint de cancer, on peut choisir un ou plusieurs marqueurs pour évaluer l’efficacité des traitements ou apprécier l’état actuel de la maladie. Un taux élevé d’un de ces marqueurs ne signifie pas forcément la présence d’un cancer.
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Carcinome à Cellules de Merkel (CCM)
Les principaux facteurs de risque de CCM sont l’âge avancé, l’exposition solaire et l’immunodépression. Le traitement est avant tout chirurgical, avec des marges d’exérèse de 3 cm.
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